滨海市警局的清晨，阳光透过窗户洒在办公桌上。陈昭、林薇月、陆沉、韩寒、孙鹏和林宇正像往常一样整理着文件，讨论着近期的案件。突然，一阵急促的电话铃声打破了平静。陈昭顺手拿起听筒，电话那头传来一个带着哭腔，声音颤抖的女人声音：“警察……警察同志，我要报案！我丈夫乘坐的航班出事了！”
陈昭迅速打开笔记本，问道：“女士，您先冷静一下，慢慢说。请问是哪趟航班？出了什么事？”女人抽泣着回答：“是从滨海飞往南城的3504航班，我丈夫登机前还和我通了电话，可飞机起飞后没多久，航空公司突然通知我，说这趟航班压根就不存在！”陈昭皱了皱眉头，心想这报案内容实在离奇，航班怎么会凭空消失？他安抚女人几句，记下相关信息后，立刻召集队员开会讨论。
“一个已经登机起飞的航班，航空公司却告知家属不存在，这背后肯定有问题。”陈昭严肃地说道。林薇月点头表示同意：“有可能是航空公司信息有误，也可能是有人故意隐瞒。我们得先和航空公司取得联系，核实情况。”陆沉主动请缨：“我来负责调查航空公司的航班记录和调度系统，看看能不能找到这趟航班的踪迹。”韩寒则补充道：“我去查一下机场的监控，看看乘客登机和飞机起飞前后有没有异常情况。”孙鹏也不甘示弱：“我联系机场安保，了解一下当天机场的整体安保状况。”陈昭点点头说“都这么主动，好，大家迅速行动起来。”
陆沉第一时间赶到航空公司总部，向相关负责人表明身份和来意。负责人一脸诧异，连忙安排技术人员调出当天的航班记录。然而，无论怎么查询，系统里都没有3504航班的任何信息，仿佛这趟航班从未在计划之中。陆沉不死心，要求查看航班调度日志和工作人员的操作记录，依然一无所获。与此同时，韩寒在机场监控室里，反复查看当天3504航班预计登机和起飞时间段的监控视频。奇怪的是，监控画面中，在原本应该是3504航班登机口的位置，没有任何航班信息显示，也没有乘客在那里排队登机的画面，就好像这个航班从一开始就被从现实中抹去了一样。
孙鹏与机场安保人员沟通后，也没有得到任何有用的线索。机场当天安保情况一切正常，没有发生任何异常事件。陈昭将大家收集到的信息汇总后，越发觉得此事诡异。一个实实在在有乘客登机的航班，为何在航空公司系统和机场监控中都毫无踪迹？难道这一切都是报案女子的幻觉？但她在电话中的恐惧和悲伤又不像是装出来的。陈昭对林宇说“你和月月你们俩去报案人那里了解一下更多的细节。”“是！”
林宇和林薇月按照地址找到了报案女子的家。女子叫张悦，看起来神色憔悴，双眼红肿，显然是刚刚经历了巨大的打击。林宇轻声安慰她后，开始询问具体情况。张悦回忆道：“我丈夫叫郑明，他是一家公司的业务经理，经常出差。这次去南城也是为了谈一笔重要的生意。登机前他还笑着和我说，等回来给我带礼物。可没过多久，航空公司就打电话说没有这趟航班，我当时就懵了……”张悦说着，又忍不住哭了起来。
林宇递给她一张纸巾，继续问道：“张女士，您丈夫登机前有没有和您说过什么特别的事？或者他近期有没有遇到什么奇怪的人或事？”张悦擦了擦眼泪，思索片刻后说：“他前几天确实说过，感觉自己好像被人跟踪了，有几次下班回家，总觉得后面有辆车跟着他。我当时还以为他是工作太累，产生错觉了，就没太在意。”林宇和林薇月对视一眼，这显然是一条重要线索。林宇又问：“那您知道您先生这次出差有没有带什么重要的东西？比如文件、贵重物品之类的？”张悦想了想回答：“他说过要带一份公司的机密文件，用于和南城的客户签约，但具体是什么文件，我也不清楚。”
离开张悦家后，林宇和林薇月觉得这起案件越来越复杂。航班失踪、丈夫被跟踪、携带机密文件，这些线索之间似乎有着千丝万缕的联系。
林宇给陈昭打了电话，电话里“喂头，失踪人叫郑明，报案人叫张悦，她说郑明前几天和她说，感觉自己被跟踪了，但也没太在意，这次出差去南城签合同，说是公司机密，你说我们要不要从他的公司入手调查一下那份机密文件的内容，以及他近期的工作情况吗？”“行，你们两个去看一看。”挂了电话，两人直奔郑明所在公司。
林宇和林薇月来到郑明所在的公司，向公司负责人说明来意。负责人对郑明的失踪也感到十分震惊，表示会全力配合警方调查。在查看郑明的工作资料时，他们发现郑明近期负责的项目涉及到一项重大的技术突破，这项技术如果成功应用，将会给公司带来巨大的利益，同时也会对整个行业产生深远的影响。而郑明携带的机密文件，很可能就是关于这项技术的核心内容。
林宇询问公司负责人：“既然这份文件如此重要，公司在安保方面有没有采取特殊措施？”负责人无奈地说：“我们采取了一些常规的保密措施，文件加密、专人护送等。但没想到还是出了这种事。而且，最近公司内部竞争也很激烈，有几个员工为了争夺这个项目的主导权，闹得很不愉快。”林宇心中一动，难道是公司内部人员为了获取机密文件，策划了这起航班失踪事件？
林宇和林薇月对与该项目有竞争关系的几名员工展开调查，发现其中一名叫王强的员工嫌疑最大。王强近期经济状况不佳，一直在为项目的事情和郑明发生争执，而且在郑明失踪前，有人看到他和一个神秘人在公司附近交谈。林宇和林薇月决定先告诉陈昭，陈昭知道后说“你们两个对王强进行深入调查，看看他是否与航班失踪案有关。”
就在林宇和林薇月准备对王强展开调查时，微信群里，陆沉那边传来了新的消息：陆沉：我在对航空公司的进一步调查中，发现了一个隐藏的备份系统。在这个备份系统里，找到了3504航班的相关信息。这趟航班并非正常的客运航班，而是一架临时调配的包机，乘客名单上除了郑明，还有另外几个身份不明的人。”
几人意识到，这趟航班失踪案背后可能涉及到一个更大的阴谋。陈昭让陈昭和韩寒立刻对备份系统中乘客名单上的其他人员展开调查，两人发现这些人都与一个神秘的商业组织有关。这个组织一直在暗中从事非法商业活动，试图通过窃取各大公司的机密来获取利益。陈昭推测，这个神秘组织很可能就是策划航班失踪案，抢夺郑明携带机密文件的幕后黑手。而王强，很可能只是他们的一枚棋子。