两个月前，宇智波鼬屠杀宇智波全族，从木叶叛逃，成为木叶叛忍，宇智波佐助中了高阶幻术，凭借着顽强意志力勉强活着，在木叶村医疗室躺了整整一个月，这才从那无尽的折磨中苏醒。
他的意志力在那没日没夜的折磨中，从一开始的萎靡，到不得已接受，再到最后的奋起反抗变得逐渐坚强，将自己那尚未完全迸发出来的压在心底的天赋，彻底释放出来。
那一个月的幻术生活里，佐助一睁开眼睛，就能看见那张沾染着父母之血的眼睛，那双属于他最为敬爱的哥哥，宇智波鼬的眼睛，那双总是含着温柔与笑意，但此时却只剩下陌生的眼睛。
外人说的没错，作为同父同母所出的孩子，他也好，佑香也好，包括…那个人也好，他们长得极为相似，在看见对方眼睛时，佐助总有种在和自己对视的感觉。
他之所以能从无尽的折磨中醒来，一方面源于外界的治疗，另一方面，是他忽然想起，佑香在那灭族之夜时…所出现的地方。
佐助和佑香在校门口分开，他看着佑香和千手松翡一起往医务室走，当时佑香说过，卡卡西受伤了，她想去看一下，看完就会回家。而佐助在昏迷前的最后一秒，分明看到了佑香的衣角出现在离他不远的树干后。
佑香当时已经在家里了！
得到这个消息的佐助愈发的慌乱，他担心已经杀害了父母的宇智波鼬，还会对最小的妹妹下手，他不能看着同胞妹妹的逝去，佑香是他在世界上的唯一一个亲人…亦是他的同胞妹妹，他不能看见同胞妹妹的逝去！
因此佐助在后面一段时间里，无时无刻的都在朝着宇智波鼬反抗——原本，对于佐助的幻术，宇智波鼬就没有下的多深，如果佐助早一点在幻术中醒悟，醒过来的时间还会更早一些，但佐助的颓靡导致他在幻术里待了很长一段时间，这也是鼬未曾料到的事情。
在醒过来后，佐助看见了前来探望的井野和小樱，却没能看到自己的妹妹。
井野和小樱面对着他的问询，支支吾吾的，愣是不愿意告知实情，后来他冷着脸，抓住了在门口张望的漩涡鸣人，这才从对方口中知道了事实。
宇智波佑香失踪了。
在宇智波鼬叛逃，宇智波富岳夫妻二人惨死，宇智波佐助重伤昏迷的时候。
木叶村派了人前去宇智波家族清理尸体，但他们并没有看到宇智波佑香的尸体，现场很干净，没有任何关于宇智波佑香的踪迹，兴许是被宇智波鼬带走了。
但一个七岁的、尚且不是忍者的小孩，不能被定义为叛忍，只能被定义为失踪。
其他的族人尸体已经被集中焚烧了，这件事情做的很隐晦，除了忍者们没什么人知道，而宇智波佐助在醒来后的第一件事情就是去将父母和族人的骨灰全部送进宇智波祠堂中。
木叶送来的牌位里，除了族人们所用的之外，还额外多出来一个，刻着宇智波佑香的名字，被佐助看到后，狠狠的砸在了门上，将牌位砸成两半，过了会儿，又去默默地捡回来，拼凑在一起。